연말정산 의료비 공제 대상 정리 2026｜누가·얼마까지 공제되나

연말정산 준비를 하다 보면 가장 헷갈리는 항목이 바로 의료비 공제입니다. 병원·약국에 돈을 많이 쓴 것 같은데, 실제로는 공제가 안 되거나 생각보다 환급이 적어서 의외라는 분들이 많습니다. 특히 2026년 연말정산에서는 6세 이하 자녀 의료비 전액 공제, 산후조리원 비용 공제 대상 확대 등 규정이 조금씩 바뀌어 무엇이 공제 대상인지 다시 정리할 필요가 있습니다. 이 글에서는 2026년 연말정산 기준 의료비 공제 대상, 한도와 공제율, 제외되는 항목까지 한 번에 정리해 드리니, 올해 병원비를 얼마까지 공제받을 수 있을지 감을 잡아 보세요.

요약: 2026년 연말정산 의료비 공제는 근로자가 본인·배우자·자녀 등 기본공제 대상자를 위해 지출한 의료비 중 총급여 3%를 초과하는 금액에 대해 15~30% 세액공제를 해 주며, 본인·6세 이하·65세 이상·장애인·난임·미숙아 관련 의료비는 한도 없이, 미용·성형·건강보조식품 등은 공제 대상에서 제외됩니다.

연말정산 의료비공제요약

연말정산 의료비 공제는 근로소득이 있는 사람이 본인과 가족을 위해 병원·약국 등에 쓴 비용 중 일정 금액을 세금에서 직접 빼 주는 제도입니다. 단순 소득공제가 아니라 산출세액에서 바로 차감되는 ‘세액공제’이기 때문에, 같은 금액이라도 다른 공제보다 체감 효과가 큰 편입니다.

기본 원칙은 “총급여의 3%를 넘는 의료비만 공제 대상”이라는 점입니다. 예를 들어 총급여가 4,000만 원이라면 120만 원(4,000만×3%)을 넘는 부분부터 의료비 세액공제로 인정됩니다. 이 가운데 본인·6세 이하 자녀·65세 이상·장애인 의료비는 금액 한도 없이, 그 외 가족 의료비는 연 700만 원 한도 내에서 공제 대상이 됩니다. 난임 치료비·미숙아·선천성이상아 관련 의료비는 공제율이 더 높게 적용됩니다.

2026년 연말정산에서 주목할 점은 6세 이하 부양가족 의료비의 연간 공제 한도가 폐지되어 전액 공제 대상이 된다는 점과, 산후조리원 비용이 소득 수준과 관계없이 출산 1회당 200만 원까지 공제된다는 점입니다. 반면 미용·성형, 건강보조식품 구입비 등은 여전히 공제 대상에서 제외되므로, 올해 지출한 병원비 중 어떤 부분이 실제 공제되는지 구분해 보는 것이 중요합니다.

• 의료비 세액공제는 총급여 3%를 초과한 금액에 대해 15~30% 세액을 깎아 주는 제도입니다.
• 본인·6세 이하·65세 이상·장애인 의료비는 한도 없이, 그 외 가족 의료비는 연 700만 원 한도 내에서 공제됩니다.
• 2026년 연말정산에서는 6세 이하 의료비 전액 공제, 산후조리원 비용 공제 확대 등 영유아·출산 관련 혜택이 강화되었습니다.

공제대상범위한도정리

공제 대상 가족 범위는 생각보다 넓습니다. 기본공제 대상자인 본인, 배우자, 직계존비속(부모·조부모·자녀·손자녀), 형제자매, 위탁아동 등에 대해 지출한 의료비가 포괄적으로 포함됩니다. 배우자나 미혼 자녀의 의료비는 같은 주소에 살지 않거나 소득이 있어도 공제가 가능한 경우가 많아, ‘함께 사는 가족만 된다’고 오해하지 않는 것이 중요합니다.

공제 대상 의료비에는 병원·의원·치과·한의원 진료비, 약국 처방약 비용, 입원비·수술비, 건강보험 본인부담금, 일부 보청기·휠체어 등 의료기기 구입·임대료, 장애인 보조기구, 장애인활동지원 서비스 본인부담금 등이 포함됩니다. 출산 후 산후조리원에 지급한 비용은 출산 1회당 200만 원 한도로 의료비 공제 대상이며, 6세 이하 자녀 의료비는 연간 공제 한도 없이 전액 공제 대상이 됩니다.

반대로 공제 대상에서 제외되는 대표적인 항목도 꼭 기억해야 합니다. 미용·성형 목적의 수술비, 쌍꺼풀·코 성형처럼 외관 개선만을 위한 시술비, 비타민·영양제·건강보조식품·보약 등 단순 건강증진 목적 의약품 구입비는 의료비 공제로 인정되지 않습니다. 또한 실손보험금으로 보전받은 금액, 건강보험 본인부담상한제 환급액 등 환급받은 부분은 의료비 공제에서 제외되므로, 실제로 본인이 부담하고 남은 금액만 공제 대상이라고 이해하면 됩니다.

• 공제 대상 가족은 본인·배우자·부모·자녀·형제자매 등 기본공제 대상자로, 동거 여부와 소득 유무에 따라 폭넓게 인정됩니다.
• 병원·약국·치과·한의원 진료비, 의료기기·장애인 보조기구, 산후조리원 비용 등은 조건에 따라 의료비 공제 대상이 됩니다.
• 미용·성형·건강보조식품·보약, 실손보험금·본인부담상한제 환급분 등은 의료비 세액공제 대상에서 제외되니 구분해 두어야 합니다.

의료비공제준비3단계

실제로 연말정산 의료비 공제를 준비할 때는 “대상 가족 정리 → 간소화 자료 점검 → 누락분 수기 입력”의 세 단계로 정리하면 편합니다. 먼저 올해 의료비를 지출한 가족을 정리하면서, 본인·배우자·자녀·부모 등 기본공제 대상에 해당하는지 확인해 둡니다. 특히 6세 이하 자녀, 65세 이상 부모, 장애인의 의료비는 한도 없이 공제가 가능하므로 따로 표시해 두면 나중에 합산할 때 도움이 됩니다.

다음으로 국세청 홈택스·손택스의 ‘연말정산 간소화’ 메뉴에서 의료비 자료를 조회합니다. 병원·약국·산후조리원 등에서 제출한 자료가 자동으로 모이지만, 비급여 진료나 일부 의료기기 비용, 해외 의료비, 현금 결제 후 누락된 영수증 등이 있을 수 있으므로 간소화 자료만 믿지 말고 실제 영수증과 금액을 한 번 더 비교해 보는 것이 좋습니다.

마지막으로 간소화 자료에 잡히지 않은 의료비가 있다면, 회사 연말정산 프로그램이나 홈택스 ‘편리한 연말정산’ 화면에서 직접 금액과 병원명을 입력해 추가합니다. 이때 실손보험으로 돌려받은 금액, 건강보험 환급분은 의료비에서 빼고 입력해야 합니다. 이렇게 가족·대상·누락분을 한 번에 정리해 두면, 2026년 연말정산에서 의료비 공제 누락 없이 환급금을 극대화하는 데 큰 도움이 됩니다.

• 먼저 의료비를 지출한 가족을 정리하고, 6세 이하·65세 이상·장애인·난임·미숙아 관련 의료비는 따로 표시해 둡니다.
• 연말정산 간소화 서비스에서 의료비 자료를 조회한 뒤, 실제 영수증과 비교해 누락·오류 여부를 점검합니다.
• 간소화에 나오지 않는 의료비는 실손보험·환급분을 제외한 실제 부담액만 수기 입력해 공제 누락을 막습니다.

정리: 2026년 연말정산 의료비 공제는 “총급여 3% 초과분만, 그러나 본인·영유아·고령자·장애인·난임·미숙아 관련 의료비는 한도 없이”라는 큰 틀을 이해하는 것이 핵심입니다. 여기에 산후조리원 비용, 장애인활동지원 본인부담금 등 새롭게 확대된 항목과 미용·성형·건강보조식품처럼 여전히 제외되는 항목을 구분해 두면, 어떤 비용을 집중적으로 챙겨야 할지 선이 잡힙니다. 연말정산 간소화 자료와 실제 영수증을 꼼꼼히 맞춰 보고, 누락된 의료비를 직접 입력해 두면 2026년 연말정산에서 의료비 공제를 최대한 활용해 환급금을 키울 수 있습니다.